MHC-NP

Un outil en python permettant d’identifier les peptides naturellement traités par la voie des MHC-I.

# Importer la classe de prédiction 
from mhc_np.prediction import Predictor 

# Créer une instance de prédicteur  
p = Predictor() 

# Effectuer des prédictions 
p.predict('HLA_A_0201', ['AAALSQALRL', 'KLWQTPLHV', 'FVSTMPVET']) 

MHC-NP est maintenant hébergé par l’Immune Epitope Database http://tools.immuneepitope.org/mhcnp/

Sébastien Giguère, Alexandre Drouin, Alexandre Lacoste, Mario Marchand, Jacques Corbeil, and François Laviolette. « MHC-NP: Predicting peptides naturally processed by the MHC. » Journal of immunological methods 400 (2013): 30-36.