MHC-NP maintenant disponible en ligne!

L’Immune Epitope Dabase (IEDB), plus importante base de données publique dans le domaine de l’immunologie, compte maintenant MHC-NP parmi ses outils d’analyse en ligne. Les utilisateurs peuvent télécharger des séquences d’acides aminés en format fasta et obtenir une prédiction des peptides naturellement présentés par les molécules du complexe majeur d’histocompatibilité de type I (MHC-I).

Cet outil, développé par Sébastien Giguère et Alexandre Drouin, a été utilisé pour remporter la 2nd Machine Learning Competition in Immunology (2012).

L’équipe du GRAAL tient à remercier Jason Greenbaum, Directeur du groupe de Bioinformatique au La Jolla Institute for Allergy and Immunology, et son équipe pour leur travail lors de l’intégration de MHC-NP à l’IEDB.

MHC-NP est disponible en ligne au : http://tools.immuneepitope.org/mhcnp/ et une implémentation Python est disponible au: http://graal.ift.ulaval.ca/downloads/mhcnp/